En esta ocasión, el jugador podrá manejar al profesor Aronnax y a sus amigos Ned Land y Consejo, quienes caen prisioneros del Capitán Nemo y son conducidos por los océanos, a bordo del ya mítico Nautilus.

A lo largo de ocho capítulos de los que consta el videojuego, recorreremos los principales momentos de la obra de Julio Verne, adaptados específicamente a las edades de los jugadores. La expedición a bordo del buque Abrahan Lincoln, el descubrimiento de una isla metálica sobre la superficie del mar, los secretos de la misteriosa embarcación del Capitán Nemo o el plan de fuga, son entre muchos otros, algunos de los maravillosos momentos que podremos vivir, o revivir, en esta aventura.

La historia se sitúa hacia finales del siglo XIX, cuando el profesor Aronnax, decide investigar el hundimiento de numerosas embarcaciones en alta mar, supuestamente por el ataque de una criatura submarina gigante. A partir de ese momento, Aronnax y sus amigos, se verán inmersos en un sinfín de emocionantes situaciones, pruebas y enigmas que resolver.